溼地保育區生態環境
溼地保育區包括綽爾河發源地、綽爾河上游的主要支流以及綽爾河水源涵養區和部分綽爾河主河道，總面積4755.08h㎡,佔溼地公園總面積的89.99%，其中溼地面積2199.40h㎡，佔溼地公園全部溼地面積的85.86%。溼地保育區是綽爾河河流發源的主要區域，包括河流溼地和沼澤溼地，其生態系統儲存完整，自然狀態較好，不僅是綽爾河的發源地，也是當地野生動植物的重要棲息地，區域內沒有建築設施和人為干擾，溼地外圍有山體和森林形成天然保護屏障。在此區域開展水源地保護、水質監測、水岸巡護管理、野生動植物資源普查和動植物棲息地保護等工程，除必要的管護和監測活動外，不得開展任何與溼地保護工作無關的活動，努力涵養溼地水源、保護溼地生態系統、提高生物多樣性。
保育區內的山林是野豬、棕熊、狼、貂熊、猞猁、赤狐、松鼠、貉子、雪兔、梅花鹿、狍子、原麝等獸類以及各種林鳥的主要棲息地。該區域與巴林林業局及綽爾林業局交界，山體延綿，人跡罕至，天然次生的興安落葉松林、白樺林、針闊混交林經歷了數十年甚至上百年的自然生長，形成了穩定良好的森林生態系統。
保育區內的溼地是中華秋沙鴨、灰鶴、蓑羽鶴、鴻雁、小天鵝、蒼鷺、鸕鶿、鴛鴦、小杓鷸等水禽的繁殖地或棲息地，是金雕、雀鷹、燕隼、雕鴞等猛禽的捕食場所，是哲羅魚、細鱗魚、雅羅魚、銀鯽、花鰍、湖鱥等淡水魚類的典型生境，也是水獺、草兔、黃鼬、沼澤田鼠、東北鼢鼠等獸類經常出沒的活動場所。該區可進入程度低，植被儲存著良好的原生形態，人為擾動非常有限。但是，每年6月，沼澤內會生長出大量金蓮花，當地人為增加收入，會進行採摘，對野生動植物及其棲息地帶來一定程度的擾動。
將溼地保育區的林地全部劃入禁伐區，嚴格保護植被不受破壞和干擾，保障現有森林生態系統的完整性、穩定性與多樣性，為野生動物提供良好的棲息環境。
禁止在溼地保育區內採摘野菜、林果或野生中藥材、放養牲畜、割草等，控制人們在科普宣教區與合理利用區的活動，使野生動植物棲息地繼續保持良好的自然性。
保育區生態環境
（1）整個保育區基本處於自然狀態，人為干擾基本被杜絕；
（2）在溼地保育區內開展了保護、監測等必需的保護管理活動；
（3）該區域具有相對明顯的溼地生態特徵和完整的溼地生態過程，具有豐富的生物多樣性，是溼地生物的棲息場所及遷徙通道，生態敏感度較高、生態抗逆性較強，具有特殊保護價值；
（4）在這裡不進行任何與森林和溼地生態系統保護管理無關的活動；
（5）加強了對整個區域的實時監控和科研監測，該區嚴格控制工程開發專案，禁止遊人進入該區。
目前，整個保育區基本處於自然狀態，沒有人為干擾。在溼地保育區內開展保護、監測等必需的保護管理活動，該區域具有相對明顯的溼地生態特徵和完整的溼地生態系統，具有豐富的生物多樣性，是溼地生物的棲息場所及遷徙通道，生態敏感度較高、生態抗逆性較強，具有特殊保護價值，在這裡不進行任何與森林和溼地生態系統保護管理無關的活動。加強對整個區域的實時監視和科研監測，該區已經嚴格控制工程開發專案等，禁止遊人進入該區域。
綜上所述，綽源國家溼地公園內有森林生境、水體生境、沼澤生境。多種生境構成了多樣生態系統，幾乎涵蓋了內蒙古大興安嶺林區所有的溼地生態系統型別。整個綽源國家溼地公園的溼地在涵養水源、調蓄洪峰、調節氣候、改善水質以及旅遊、養殖和灌溉等方面的功能十分突出，良好的生態環境也為大量的野生生物提供棲息地。